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天津工生所完成工業(yè)上丁醇發(fā)酵重要菌株的全基因組測序

2012-03-28 08:49 來源: 作者:
  Clostridium acetobutylicum是工業(yè)上丁醇發(fā)酵的重要菌株,了解其發(fā)酵代謝等途徑對于更多地獲得目的產(chǎn)物至關(guān)重要。此外,丁醇對于細(xì)胞具有一定的破壞作用,因此,提高細(xì)胞的耐受性也是必要的。隨機(jī)突變與表型篩選主要用于微生物功能的研究。然而,每個突變株可能含有50-100個隨機(jī)突變位點(diǎn),導(dǎo)致工作量非常大,并且數(shù)據(jù)分析較為困難。

  中科院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所陳祖耕研究員與中科院微生物研究所馬延和研究員、李寅研究員合作,首先完成了Clostridium acetobutylicum DSM1731菌株的全基因組測序。并應(yīng)用表型測序(phenotype sequencing),對細(xì)胞丁醇耐受基因進(jìn)行了分析。

  此項(xiàng)研究為Clostridium acetobutylicum丁醇發(fā)酵等代謝提供了基因水平的依據(jù),并快速揭示了與丁醇耐受相關(guān)的基因族。這些結(jié)果有助于對工業(yè)菌株改造提出理性設(shè)計(jì),為獲得高產(chǎn)丁醇的菌株提供了幫助。另外,表型測序技術(shù)也為相應(yīng)的領(lǐng)域,包括重要基因的篩選、耐受基因的篩選等提供了一條簡單快捷的途徑。

  相關(guān)研究結(jié)果已經(jīng)發(fā)表于國際學(xué)術(shù)刊物J. Proteome Res.,PloS ONE 和J. Bacteriol.上。

  J. Bacteriol.論文鏈接

  PloS ONE 論文鏈接

  J. Proteome Res.論文鏈接 
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